اپلتون بریج، رهبر مدنی در سال ۱۹۲۴ به شهرداری پیشنهاد تأمین بودجه ساخت محلی دائمی برای نگه‌داری یک مجموعه هنری را داد و در همان سال، در ضلع شمالی میدان پاناما در پارک بالبوآ ساخت‌و‌ساز آن سازه آغاز شد. در سال ۱۹۲۵ انجمن هنرهای زیبا از پیوستن انجمن هنر سن‌دیه‌گو و دوستان هنر، برای راه‌اندازی موزه جدید تشکیل شد. در معماری موزه هنر سن‌دیه‌گو طراحان آن، ویلیام جانسون و همکارش، رابرت دبلیو از طرح پیشنهادی سبک استعماری اسپانیایی فراتر رفتند و به‌شکل مستقیم از مدل‌های رنسانسی قرن شانزدهم در سبک پلاترزک الهام گرفتند.